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當癌細胞 “匿名作案”,醫生如何破局?
王阿姨體檢時(shí)發(fā)現淋巴結轉移瘤,但跑遍了各大醫院,始終查不出腫瘤的原發(fā)部位。這種被稱(chēng)為“原發(fā)灶不明腫瘤(carcinoma of unknown primary,CUP)”的疾病,就像癌細胞在人體內“匿名作案”——它們四處轉移,卻藏起了最初的“犯罪現場(chǎng)”。
據統計,CUP占所有新發(fā)癌癥的1%~3%,每年全球約有數十萬(wàn)患者陷入類(lèi)似王阿姨的困境。更棘手的是,由于找不到原發(fā)灶,醫生往往只能采用經(jīng)驗性化療,而這對多數患者效果甚微,中位生存期通常不足1年。
面對“匿名”的癌細胞,真的就束手無(wú)策嗎?近期發(fā)表在《nature communications》的一項研究闡述了全基因組和轉錄組測序(WGTS)像一臺“基因偵探儀”,不僅能精準定位腫瘤的“老家”,還能為患者打開(kāi)靶向治療的新大門(mén)。
傳統檢測 VS 基因測序:誰(shuí)是“破案高手”?
01.傳統檢測:像用“放大鏡”找線(xiàn)索
目前,臨床常用的基因panel檢測(檢測 386~523個(gè)基因)如同用“放大鏡”勘察現場(chǎng):它能發(fā)現部分突變,但視野有限。比如,當腫瘤存在染色體結構變異(SV)或拷貝數變異(CNV)時(shí),panel檢測常?!傲Σ粡男摹?。
02.WGTS:升級為“全景監控”
WGTS則像裝上了“全景監控”:它不僅能覆蓋全基因組的所有基因,還能結合轉錄組數據,從DNA和RNA兩個(gè)層面解析腫瘤特征。研究顯示,在71對CUP病例中,WGTS檢測到的診斷或治療相關(guān)突變比panel多76%,尤其是SV和 CNV這類(lèi)關(guān)鍵線(xiàn)索,98%的SV僅能被WGTS發(fā)現。
圖1.WGTS和Panel在CUP治療及診斷相關(guān)突變的檢測能力對比
舉個(gè)例子:如果把癌細胞比作“作案團伙”,panel檢測只能識別幾個(gè)“小嘍啰”(個(gè)別基因突變),而WGTS能揪出“團伙頭目”(如染色體大片段異常),甚至還原“作案手段”。
WGTS三大突破:讓癌細胞“無(wú)處遁形”
突破一:揪出“偽裝者”,鎖定腫瘤老家
CUP患者的腫瘤就像“偽裝者”,常常失去原發(fā)灶的典型特征。但WGTS能通過(guò)“基因指紋”識別它們:
研究團隊用WGTS數據訓練了一個(gè)名為 CUPPA的算法,它能像“人臉識別系統”一樣,根據基因突變特征判斷腫瘤起源。在臨床病理無(wú)法確診的病例中,WGTS結合CUPPA73%(41/56)的腫瘤“現出原形”,而傳統panel檢測僅能解決34%(19/56)。
圖2.基于WGTS的CUPPA算法增加腫瘤組織溯源率
突破二:打開(kāi)“治療寶庫”,精準匹配藥物
找到原發(fā)灶不僅是“破案”,更能為治療指明方向:
WGTS能發(fā)現更多可靶向的基因突變,如 BRAF、PIK3CA等,還能識別同源重組缺陷(HRD)、微衛星不穩定(MSI)等特征,這些都是靶向治療的“鑰匙”。數據顯示,WGTS為51/72例(71%)提供了標準治療方案,39/72例(54%)匹配了臨床試驗,而panel 的對應比例為42%和41%。
圖3.WGTS可影響臨床對CUP患者的管理決策
突破三:抽管血就能測,微創(chuàng )也能“破案”
很多CUP患者由于腫瘤位置特殊,難以獲取組織樣本。但WGTS還能“解鎖”血液檢測:
研究發(fā)現,在22例ctDNA突變頻率>7%的樣本中,9例(41%)通過(guò)CUPPA獲得高可能性預測,且與病理診斷高度一致,實(shí)現高準確性的原發(fā)灶預測。這意味著(zhù),未來(lái)可能只需抽管血,就能完成“基因破案”。
圖4.ctDNA在腫瘤組織溯源中的應用
精準醫療時(shí)代:讓每一個(gè)癌細胞都“有跡可循”
CUP的診治困境,曾是腫瘤學(xué)的一大痛點(diǎn)。但WGTS的出現,就像為醫生配備了“基因導航”:不僅能回答“癌細胞從哪里來(lái)”,還能指導“治療往哪里去”。
當然,目前WGTS仍有優(yōu)化空間,比如進(jìn)一步提高cfDNA檢測的靈敏度,或完善對罕見(jiàn)癌癥的預測算法。但正如研究作者所說(shuō):“全基因組測序正在改寫(xiě)CUP的診療規則,未來(lái),或許不再有‘未知原發(fā)’的癌癥,只有尚未被精準解析的基因密碼?!?/span>
參考文獻
Nat Commun. 2025 May 20;16(1):4422. doi: 10.1038/s41467-025-59661-x.