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KRAS基因檢測在LGSOC中的應用

新聞來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:[2025-06-25]


01.前言

 

低級別漿液性卵巢癌(LGSOC)是一種較為少見(jiàn)的卵巢上皮癌(EOC),約占全部卵巢癌的5%。LGSOC與高級別漿液性卵巢癌(HGSOC)的分子通路、生物學(xué)行為、臨床特征不同。LGSOC多見(jiàn)于年輕女性,中位發(fā)病年齡43歲,較HGSOC發(fā)病年輕10歲。其生長(cháng)緩慢,腫瘤呈惰性,且對以鉑類(lèi)為基礎的化療相對不敏感。雖然與HGSOC相比預后較好,但III/IV期腫瘤的長(cháng)期生存數據仍不理想。LGSOC通常繼發(fā)于漿液性交界性腫瘤(SBOT),常見(jiàn)BRAF和KRAS基因突變。高分期腫瘤中少見(jiàn)BRAF突變,KRAS突變可能是LGSOC進(jìn)展的驅動(dòng)因素。絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路在LGSOC發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用,靶向該通路的療法在LGSOC的治療中顯得尤為關(guān)鍵[1-3]。

 

02.LGSOC的分子機制

 

LGSOC通常繼發(fā)于SBOT,LGSOC的組織形態(tài)、分子通路與SBOT的相關(guān)度達到75%以上。SBOT經(jīng)過(guò)一系列的基因突變進(jìn)展成為L(cháng)GSOC,其中包括BRAF、KRAS和ERBB2基因,最終導致MAPK通路持續活化[3]。LGSOC經(jīng)常攜帶KRAS(19%~55%)和BRAF(0~33%,平均5%)基因突變,也可能存在NRAS、USP9X和EIF1AX突變,染色體9p缺失或CDKN2A/2B雜合性缺失。BRAF基因在LGSOC中的突變頻率低于SBOT(5% vs 23%-48%),且BRAF突變患者預后更好,提示BRAF可能為保護性基因。KRAS基因突變可能是LGSOC進(jìn)展驅動(dòng)因素,與腫瘤復發(fā)有關(guān)[2-3]。此外,NRAS突變僅限于浸潤性癌癥中,NRAS突變患者年齡大、晚期疾病比例更高,殘留病灶更多[4]。除了基因突變外,MAPK通路基因的缺失和融合可能也與MEK抑制劑療效相關(guān);部分LGSOC患者也可能存在PI3K等通路活化[3]。

 

Dane Cheasley等研究者分析了來(lái)自全外顯子組(WES)測序隊列的71例LGSOC患者的127個(gè)候選基因,以生成突變和拷貝數變異數據;并進(jìn)行了免疫組織化學(xué)(IHC)檢測,評估了雌激素受體(ER)、孕激素受體(PR)、p53和CDKN2A狀態(tài)。靶向測序發(fā)現47%的病例存在MAPK通路基因(KRAS(26.7%)、BRAF(12.6%)和NRAS(8.5%))突變,以及USP9X(27%)、MACF1(11%)、ARID1A(9%)等驅動(dòng)基因突變。IHC顯示常見(jiàn)ER/PR陽(yáng)性(85%),CDKN2A蛋白丟失(10%)或過(guò)表達(6%),所有樣本均為p53野生型。與HGSOC不同,LGSOC的同源重組修復缺陷(HRD)評分平均僅為3(0-48)分,僅有3例評分大于42分被判為陽(yáng)性[5]。

 

 

LGSOC隊列突變譜[5]

 

David M Gershenson等研究者報道了一項LGSOC隊列MAPK通路突變特征研究結果:共納入接受了高通量測序(NGS)檢測的215例LGSOC患者,診斷時(shí)的中位年齡為46.6歲,大多數為III期原發(fā)性卵巢癌。140例(65.1%)的病例中發(fā)現一個(gè)或多個(gè)突變,52.6%的患者在MAPK通路中發(fā)生突變,突變基因包括KRAS、NRAS、BRAF、MAP2K1和RAF1,最常見(jiàn)的突變是KRAS(n=71,33.0%)、NRAS(n=24,11.2%)和BRAF(n=18,8.4%)。71個(gè)KRAS突變包括33個(gè)G12D、29個(gè)G12V、3個(gè)G12A、2個(gè)G12R、1個(gè)G12S、G12C和G12_G13insAG。MAPK通路突變患者的無(wú)進(jìn)展生存(PFS)數據優(yōu)于未檢出MAPK突變的患者(31.4個(gè)月 vs 23.7個(gè)月,p=0.002)。MAPK通路突變患者的總生存(OS)數據優(yōu)于未檢出MAPK突變的患者(147.8個(gè)月 vs 89.5個(gè)月,p=0.01),亦優(yōu)于腫瘤未檢出突變的患者(147.8個(gè)月 vs 78個(gè)月,p=0.001)[6]。

 

 

215例LGSOC患者的基因突變頻率[6]

 

 

MAPK突變患者與未檢出MAPK突變患者的PFS和OS比較[6]

 

03. LGSOC的靶向療法

 

一直以來(lái),NCCN對復發(fā)性L(fǎng)GSOC系統治療的推薦主要為BRAF/MEK抑制劑:曲美替尼(2A類(lèi)證據)、Binimetinib(2B類(lèi)證據)、達拉非尼聯(lián)合曲美替尼(BRAF V600E陽(yáng)性腫瘤,2A類(lèi)證據)[7]。

 

GOG-0281研究(NCT02101788)比較了MEK抑制劑曲美替尼與標準治療組治療復發(fā)性L(fǎng)GSOC的效果,共納入260例患者,隨機1:1分配,主要終點(diǎn)為研究者評估的PFS。兩個(gè)亞組均有約一半的患者進(jìn)行了WES測序,17%的患者檢測到KRAS、BRAF或NRAS突變。與標準治療組比較,曲美替尼顯著(zhù)延長(cháng)了復發(fā)性L(fǎng)GSOC患者的中位PFS(13.0個(gè)月vs 7.2個(gè)月,風(fēng)險比(HR)=0.48,P<0.0001)??陀^(guān)緩解率(ORR)為26%比6%(優(yōu)勢比(OR)=5.4,P<0.0001),另有59%的患者疾病穩定至少8周。持續緩解時(shí)間(DOR)延長(cháng)(13.6個(gè)月vs 5.9個(gè)月)。中位OS為37.6個(gè)月vs 29.2個(gè)月(HR=0.76,P=0.056),有利于曲美替尼組。RAS/BRAF突變患者的PFS和ORR均優(yōu)于野生型患者,但無(wú)統計學(xué)差異[8]。

 

 

意向治療人群PFS的KM分析[8]

 

MILO/ENGOT-ov11研究(NCT01849874)招募了341例復發(fā)性L(fǎng)GSOC患者,以2:1隨機分配至Binimetinib組或醫師選擇的化療(PCC)組,主要終點(diǎn)為盲態(tài)獨立評審委員會(huì )(BICR)評估的PFS。303例患者的中期分析發(fā)現,Binimetinib組對比PCC組,中位PFS為9.1個(gè)月vs 10.6個(gè)月(HR=1.21,p=0.807),根據預先設定的無(wú)效邊界提前結束研究。215例接受了分子檢測,33%檢出KRAS突變。Binimetinib組中,KRAS突變與野生型患者相比,應答率為44% vs 19%(p=0.004),中位PFS為17.7個(gè)月 vs 10.8個(gè)月(p=0.006),而PCC組的PFS則沒(méi)有這種關(guān)聯(lián)(p=0.502)。其他檢測到的MAPK通路改變包括NRAS(n=11,8.1%)、BRAF V600E(n=8,5.9%)、RAF1(n=2,1.5%)和NF1(n=7,5.2%)。Binimetinib組中,MAPK變異與野生型患者相比,應答率為41% vs 13%(p<0.001),且有更長(cháng)的PFS(HR=0.5,p=0.003)[9-10]。

 

 

Binimetinib組和PCC組PFS的KM分析:A、KRAS突變,B、MAPK變異[10]

 

2022年6月22日,美國食品藥品監督總局(FDA)批準BRAF抑制劑達拉非尼聯(lián)合曲美替尼用于BRAF V600E突變的不可切除或轉移性實(shí)體瘤患者的后線(xiàn)治療。這一獲批基于多項臨床試驗結果,其中一項為NCI-MATCH試驗(NCT02465060)H亞組(EAY131-H)。研究納入了6例婦科腫瘤患者,其中5例為L(cháng)GSOC,ORR達到了80%[11]。研究的總體中位PFS為11.4個(gè)月,中位OS為28.6個(gè)月[12]。

 

在HGSOC中應用廣泛的PARP抑制劑,在臨床試驗的入組標準中清一色地沒(méi)有納入LGSOC患者[13]。前述中也提到LGSOC的分子機制與HGSOC不同,HRD評分一般較低,所以目前沒(méi)有臨床研究數據支持LGSOC患者使用PARP抑制劑的療效。

 

04. KRAS突變LGSOC的新療法

 

2025年5月8日,FDA加速批準了VERASTEM INC的Avutometinib 聯(lián)合Defactinib(AVMAPKI FAKZYNJA CO-PACK)用于至少接受過(guò)一次系統治療的、KRAS突變的復發(fā)性L(fǎng)GSOC成人患者。這是LGSOC獲批的首個(gè)KRAS靶向療法。Avutometinib(VS-6766)是一種RAF/MEK鉗夾,可以誘導無(wú)活性RAF/MEK復合物的形成,抑制RAF磷酸化MEK1/2。Defactinib是粘著(zhù)斑激酶(FAK)和富含脯氨酸的酪氨酸激酶2(Pyk2)的選擇性抑制劑, 可以抑制FAK的自磷酸化。Avutometinib聯(lián)合Defactinib增強了抑制體外細胞增殖的能力,以及包括LGSOC在內的小鼠腫瘤模型中的抗腫瘤活性[11]。

 

 

Avutometinib聯(lián)合Defactinib的作用機制[14]

 

其獲批基于開(kāi)放標簽的多中心II期RAMP-201 研究(NCT04625270),共納入57例KRAS突變復發(fā)性L(fǎng)GSOC成年患者,患者必須至少接受過(guò)一次系統治療,包括以鉑為基礎的治療方案。通過(guò)對腫瘤組織進(jìn)NGS或聚合酶鏈反應(PCR)檢測來(lái)確定KRAS突變狀態(tài), 本次FDA并未同步批準KRAS伴隨診斷檢測?;颊呖诜嗀vutometinib 3.2 mg,每周2次,口服Defactinib 200 mg,每天2次,直至疾病進(jìn)展或不可耐受的毒性。研究的主要終點(diǎn)為BICR評估的ORR[11]。

 

鑒定出的KRAS突變包括G12V(53%)、G12D(35%)、Q61H(3.5%)、G12C(1.8%)、G12R(1.8%)、A146V(1.8%)等。57例患者的ORR為44%,其中兩例完全緩解(CR),DOR范圍從3.3至31.1個(gè)月。25例應答患者的KRAS突變包括A146V、G12D、G12R、G12V和Q61H[11]。KRAS野生型患者的ORR為17%。KRAS突變型與野生型患者相比,中位DOR為31.1個(gè)月 vs 9.2個(gè)月,中位PFS為22個(gè)月 vs 12.8個(gè)月,6個(gè)月以上的疾病控制率(DCR)為70% vs 50%[15]。

 

 

RAMP-201(PART A)的腫瘤療效評估[14]

 

Avutometinib聯(lián)合Defactinib治療復發(fā)性L(fǎng)GSOC的隨機、開(kāi)放標簽的國際多中心III期RAMP-301研究(NCT06072781)正在進(jìn)行中,大約270例患者以1:1隨機分配到Avutometinib與Defactinib聯(lián)合治療組或研究者選擇的治療組?;颊弑仨毣加袕桶l(fā)性L(fǎng)GSOC(KRAS突變型或野生型),并且在至少一種鉑類(lèi)化療方案后進(jìn)展或復發(fā),不限治療線(xiàn)數,不限是否使用過(guò)MEK/RAF抑制劑。但排除HGSOC或混合組織學(xué)患者,以及接受過(guò)Avutometinib、Defactinib或其他FAK抑制劑治療的患者。主要終點(diǎn)為根據RECIST 1.1版標準,BICR評估的PFS。RAMP-301 預計的主要完成日期為2028年10月15日,預計研究完成日期為2031年2月9日[13-14]。


 

RAMP-301 研究方案[14]

 

05. 總結

 

除LGSOC之外,Avutometinib聯(lián)合Defactinib治療KRAS突變的非小細胞肺癌、胰腺癌、子宮內膜癌、黑色素瘤等癌種的研究亦在進(jìn)行中。飛朔生物具有已獲得國家藥監局III類(lèi)醫療器械注冊證的人類(lèi)K-ras基因突變檢測試劑盒(多重熒光PCR法,國械注準20223400275),亦有數十個(gè)含有KRAS基因的檢測項目。飛朔致力于為腫瘤個(gè)體化精準醫學(xué)檢測提供最具創(chuàng )新性的產(chǎn)品和服務(wù),并持續更新現有產(chǎn)品。

 

 

參考文獻

[1] 第5版WHO女性生殖系統腫瘤分類(lèi)

[2] CSCO卵巢癌診療指南2024

[3] 低級別漿液性卵巢癌的專(zhuān)家共識(2020年版)

[4] Clin Cancer Res. 2014 Dec 15;20(24):6618-30.

[5] J Pathol. 2021 Jan;253(1):41-54.

[6] Gynecol Oncol. 2022 Jun;165(3):560-567.

[7] NCCN卵巢癌包括輸卵管癌和原發(fā)性腹膜癌診療指南2025 v2

[8] Lancet. 2022 Feb 5;399(10324):541-553.

[9] J Clin Oncol. 2020 Nov 10;38(32):3753-3762.

[10] Clin Cancer Res. 2023 Oct 13;29(20):4068-4075.

[11] FDA官網(wǎng)數據

[12] J Clin Oncol. 2020 Nov 20;38(33):3895-3904.

[13] Clinical Trails官網(wǎng)數據

[14] Int J Gynecol Cancer. 2025 Jan 6:ijgc-2024-005919.

[15] Verastem Oncology在IGCS 2024年年會(huì )上呈報的更新數據